Данная игра основана на втором сезоне одноимённого аниме-сериала. Вам необходимо создать своего героя и присоединиться к команде бравлеров, которые должны спасти Землю от злого Спектры и его приспешников из организации Вексос. В отличие от предыдущих игр серии, в которых бои проходили по правилам карточной игры, в этой игре вы получаете полный контроль над своими бакуганами и можете свободно перемещаться по трёхмерным аренам.

Геймплей игры состоит из двух режимов: режима истории и режима битвы. В режиме истории вы следуете сюжету, который не был показан в аниме, и участвуете в различных миссиях. В этих миссиях вы можете использовать своего бакугана для сражения с врагами, разрушения объектов, защиты союзников или сбора предметов. Вы также можете переключаться между своим героем и его бакуганом в любое время.

В режиме битвы вы можете сразиться с другими игроками или компьютером на выбранной арене. Битвы проходят в режиме реального времени и делятся на две фазы: фазу стрельбы и фазу боя. В фазе стрельбы вы запускаете своего бакугана по траектории, пытаясь попасть в цель или собрать бонусы. В фазе боя вы управляете своим бакуганом и сражаетесь с противником, используя атаки и способности. Вы также можете активировать специальный режим Максус, который позволяет объединить шесть бакуганов в одного мощного.