Продолжение популярной серии платформеров. Сюжет игры берёт начало там, где закончилась Ratchet & Clank Future: Tools of Destruction — Рэтчету предстоит отыскать похищенного пиратами-призраками Кланка.
Во время этого приключения игрокам снова необходимо использовать разнообразное оружие и гаджеты, а также решать многочисленные головоломки.