События Ratten Reich разворачиваются в мрачном и безжалостном мире, где уже на протяжении многих лет продолжается война. В этой войне схлестнулись антропоморфные животные, среди которых есть крысы, мыши, тараканы и ящерицы.
В игре есть две разные фракции: FMR (мыши, тараканы и ящерицы) и RR (империя крыс). Игроку же необходимо выступить в лице агрессора (RR).