В основе сюжета Cryptical Path лежит попытка главного героя — Архитектора — вырваться из загадочного лабиринта под названием Гексиум, который он когда-то создал своими руками. Изначально это место задумывалось как темница для заточения злых душ, однако теперь сам Архитектор оказался в ловушке собственного творения. Продвигаясь сквозь мрачные коридоры, полные опасностей, герою предстоит по крупицам собирать информацию о тайнах Гексиума и мотивах тех, кого он некогда заточил в этой темнице.
Игровой процесс Cryptical Path объединяет в себе элементы экшена и строительного симулятора. Архитектор может в любой момент открыть интерфейс Hexium и внести изменения в архитектуру лабиринта, добавляя или убирая комнаты. Это позволяет игроку подстраивать подземелье под свой игровой стиль и текущие задачи.