События Nexus 2 разворачиваются спустя двадцать пять лет после победы над Entity. Звездные врата закрыты, человечество вновь свободно. Став свидетелями появления первых «псаев» (одаренных личностей, способных изменять пространство, материю и время одной лишь силой мысли) люди разбрелись по Солнечной системе. Но не все так просто, как кажется. На «новую форму жизни» открыта охота. Собственно, с этим и предстоит разобраться игроку. Цель, которую преследует Nexus 2, – выяснить, кто же на самом деле эти «псаи». Новый этап эволюции или, наоборот, закат человеческой цивилизации?
Игроков ждут две новые расы (последователи Сиблинг – религиозные фанатики, стремящиеся всеми силами уничтожить человечество, и Создатели (Creators) – таинственная цивилизация, в недрах которой хранятся секреты зарождения жизни в Космосе), а также возможность самостоятельно собирать космические корабли.
